I denne artikel vil vi lære at plot Michaelis Menten-diagram i Excel Vi bruger den Michaelis Menten-ligningen til at tegne grafen. Generelt bruges den til at analysere enzymernes kinetiske data. Den forklarer virkningen af substratkoncentrationen på enzymer. I dag vil vi vise trinvise procedurer for at tegne Michaelis Menten-grafen i Excel. Vi vil også lære at udtrække værdien af Michaelis Menten-konstanten. Så lad os uden yderligere forsinkelse starte diskussionen.

Download arbejdsbog til øvelser

Du kan downloade arbejdsbogen til øvelser her.

Hvad er Michaelis Menten-grafen?

I Michaelis Menten-grafen tegner vi den Reaktionshastighed (V) på den Y - akse og Koncentration af substrat ([S]) på den X - akse Grafen følger nedenstående ligning:

Det er en ligning af nul-orden.

Her,

V = reaktionens begyndelseshastighed

Vmax = maksimal reaktionshastighed

[S] = koncentration af substrat

Km = Michaelis Menten-konstant

Ved lav substratkoncentration bliver ligningen:

Det er en første ordensligning.

Trin-for-trin procedurer til at plotte Michaelis Menten-grafen i Excel

For at forklare trinene bruger vi et datasæt, der indeholder Koncentration af substrat, [S] Vi vil beregne den Reaktionshastighed (V) med Michaelis Menten-ligningen. I begyndelsen vil vi bruge uddannede værdier for Km og V-max Senere vil vi finde værdien af Km og V-max ved hjælp af de observerede og beregnede Hastighed Så lad os gennemgå følgende trin for at lære, hvordan man tegner Michaelis Menten-grafen.

TRIN 1: Indsæt Michaelis Menten-konstant og V-max-værdier

• I første omgang skal du indsætte uddannede værdier af Km og V-max .
• Lad, værdierne af Km og V-max er 10 .
• Her har vi indsat 10 i både Celle F4 og Celle F5 .

Læs mere: Plotte række nummer i stedet for værdi i Excel (med nemme trin)

TRIN 2: Beregn værdien af starthastigheden

• For det andet skal vi beregne værdien af starthastigheden.
• Til det formål bruger vi Michaelis Menten-ligningen.
• Vælg Celle C5 og indtast nedenstående formel:

Her, Celle F5 indeholder Km , Celle F4 butikker V-max , og Celle B5 gemmer den Koncentration af substrat [S] .

• Derefter skal du trykke på Indtast og træk den Håndtag til påfyldning ned.

• Som følge heraf vil du se Hastighed svarende til den Koncentration .

Læs mere: Sådan oprettes et diagram fra et udvalgt område af celler i Excel

TRIN 3: Plot Michaelis Menten-grafen med den beregnede hastighed

• For at tegne grafen skal du vælge værdierne for Koncentration og tilsvarende Hastighed .
• Her har vi valgt den område B4:C14 .

• Derefter skal du gå til Indsæt og klik på fanen Indsæt spredning ikonet. En drop-down menu vises.
• Vælg Spredning med glatte linjer og markører fra rullemenuen.

• Som følge heraf vil du se plottet på arket.

• Når du har ændret akse- og diagramtitlerne, vil grafen se ud som på billedet nedenfor.

Læs mere: Sådan plottes graf i Excel med flere Y-akser (3 praktiske måder)

TRIN 4: Bestem den indledende hastighed sammen med den observerede hastighed

• På TRIN 2 beregnede vi starthastigheden med en formel. I det tilfælde havde vi ikke absolutte værdier af Km og V-max Der blev heller ikke observeret nogen hastighed.
• Hvis du har Observeret hastighed som i datasættet nedenfor, kan du beregne starthastigheden samt værdierne for Km og V-max .

• I dette øjeblik skal du vælge Celle D5 og indtast nedenstående formel:

• Tryk på Gå ind på og træk den Håndtag til påfyldning ned.

TRIN 5: Find forskellen mellem observerede og beregnede hastigheder

• Når vi har beregnet hastigheden med Michaelis-Menten-ligningen, skal vi finde forskellen mellem den observerede og den beregnede hastighed.
• Til det formål skal du vælge Celle E5 og indtast nedenstående formel:

• Tryk nu på Indtast og træk ned i Håndtag til påfyldning for at se resultaterne.

TRIN 6: Find summen af kvadratet af forskellene

• For at finde de bedste værdier for Km og V-max skal vi bestemme summen af kvadrater af forskellene.
• For at gøre dette skal du vælge Celle E17 og indtast nedenstående formel:

Her har vi anvendt funktionen SUMSQ til beregning af summen af kvadrater af forskellene.

• Tryk på Gå ind på for at se resultatet.
• For at opnå de bedste værdier for Km og V-max , den Summen af kvadrater af forskelle skal være mindst.

TRIN 7: Plot Michaelis Menten-grafen med både observerede og beregnede hastigheder

• Hvis du vil tegne grafen med både observerede og beregnede hastigheder, skal du vælge område B4:D14 .

• Derefter skal du gå til Indsæt og klik på fanen Indsæt spredning ikonet. En drop-down menu vises.
• Vælg Spredning med glatte linjer og markører fra rullemenuen.

• Som et resultat heraf vil du se grafen for både Overholdt og Beregnet hastigheder.

Læs mere: Sådan plottes flere linjer i ét diagram i Excel

TRIN 8: Find Michaelis Menten-konstant og V-max

• For at finde Km og V-max for de observerede værdier, skal vi beregne den mindste værdi af summen af kvadraterne af forskellene.
• Til det formål skal vi tage hjælp af den Solver Add-in .
• Gå til Data og klik på fanen Løser fra Analyse sektion.
• Hvis du ikke finder den Solver Add-in , så kan du besøg dette link .

• I den Parametre for opløseren feltet, skriv den celle, der indeholder værdien af Summen af kvadrater af forskelle i den Sæt mål felt. I vores tilfælde er det Celle E17 .
• Vælg derefter Min .
• Skriv derefter de celler, der indeholder værdierne for Km og V-max i " Ved at ændre variable celler " feltet.
• Her har vi indtastet $C$16:$C$17 .
• Klik på Løs at fortsætte.

• I det følgende trin skal du klikke på OK at komme videre.

• Til sidst får du det ønskede resultat som på billedet nedenfor.

TRIN 9: Indsæt halv V-max-værdi i grafen

• For at indsætte den Halv V-max værdi, skal du oprette et diagram som på billedet nedenfor.
• Her, Celle B20 butikker 0 . også, Celle B21 og Celle B22 gemme værdien af Km .
• På den anden side, Celle C20 og Celle 21 indeholder den Halv V-max værdi. Det betyder, C17/2 . og Celle C22 butikker 0 .

• Når du har oprettet den Halv V-max tabellen, vælg grafen og højre - klik på den. Der vises en menu.
• Klik på den Vælg data mulighed derfra.

• Vælg derefter Tilføj fra den Vælg datakilde boks.

• Vælg derefter den Serie Navn , X-værdier , og Y-værdier .
• Her, Celle 19 er den Serie Navn , område B20:B22 er den X-værdier , og område C20:C22 er den Y - værdier .
• Når du har indsat værdierne, skal du klikke på OK .

• Igen skal du klikke på OK i den Vælg datakilde boks.

• Som resultat vil du se en graf som på billedet nedenfor.

Læs mere: Sådan laver du et diagram fra en tabel i Excel (5 egnede måder)

TRIN 10: Skift Series Chart Type

• Endelig skal vi ændre diagramtypen for Halv V-max værdi graf.
• Det gør du ved at vælge den Halv V-max værdigraf først og derefter, højre - klik på den. Der vises en menu.
• Vælg Ændre serien Diagramtype derfra.

• I den Ændre diagramtype boksen, ændre Diagramtype af den Halv V-max-værdi graf til Spredning med lige linjer og markører .
• Klik derefter på OK .

Endelig output

• I sidste ende vil du få det ønskede punkt, hvor Km er 9.1 15 og V-max er 7.328 .

Konklusion

I denne artikel har vi vist trinvise procedurer til at Plotte Michaelis Menten-grafen i Excel Jeg håber, at denne artikel vil hjælpe dig med at udføre dine opgaver effektivt. Desuden har vi også tilføjet øvelsesbogen i begyndelsen af artiklen. Hvis du vil teste dine færdigheder, kan du downloade den for at øve dig. Du kan også besøge ExcelWIKI-webstedet for flere artikler som denne. Endelig, hvis du har forslag eller spørgsmål, er du velkommen til at spørge i kommentarfeltet nedenfor.