Mục lục
Trong bài viết này, chúng ta sẽ học cách vẽ đồ thị Michaelis Menten trong Excel . Chúng tôi sử dụng phương trình Michaelis Menten để vẽ đồ thị. Nói chung, nó được sử dụng để phân tích dữ liệu động học của enzyme. Nó giải thích ảnh hưởng của nồng độ cơ chất đến enzyme. Hôm nay, chúng tôi sẽ trình bày các quy trình từng bước để vẽ đồ thị của Michaelis Menten trong Excel. Chúng ta cũng sẽ học cách trích xuất giá trị của hằng số Michaelis Menten. Vì vậy, không chậm trễ hơn nữa, hãy bắt đầu cuộc thảo luận.
Tải xuống Sách bài tập thực hành
Bạn có thể tải xuống sách bài tập thực hành từ đây.
Michaelies-Menten Graph.xlsx
Đồ thị Michaelis Menten là gì?
Trong biểu đồ Michaelis Menten, chúng tôi vẽ biểu đồ Vận tốc phản ứng (V) trên trục Y – và Nồng độ chất nền ([S]) trên trục X – . Đồ thị tuân theo phương trình bên dưới:
V = (Vmax*[S])/([S]+Km)
Đó là một phương trình bậc 0.
Đây,
V = Vận tốc ban đầu của phản ứng
Vmax = Vận tốc tối đa của phản ứng
[S] = Nồng độ của chất nền
Km = Hằng số Michaelis Menten
Ở nồng độ cơ chất thấp, phương trình trở thành:
V = (Vmax*[S])/Km
Đó là phương trình bậc nhất.
Quy trình từng bước để vẽ đồ thị Michaelis Menten trong Excel
Để giải thích các bước, chúng tôi sẽ sử dụng tập dữ liệu có chứa Chất nền Nồng độ, [S] . Chúng tôi sẽtính Vận tốc phản ứng (V) bằng phương trình Michaelis Menten. Ban đầu, chúng tôi sẽ sử dụng các giá trị được đào tạo của Km và V-max . Sau đó, chúng ta sẽ tìm giá trị của Km và V-max bằng cách sử dụng Velocity được quan sát và tính toán. Vì vậy, chúng ta hãy thực hiện các bước sau để tìm hiểu cách vẽ đồ thị của Michaelis Menten.
BƯỚC 1: Chèn các giá trị V-max và Hằng số của Michaelis Menten
- Đầu tiên, bạn cần chèn các giá trị đã học của Km và V-max .
- Giả sử, các giá trị của Km và V-max là 10 .
- Ở đây, chúng tôi đã chèn 10 vào cả Ô F4 và Ô F5 .
Đọc thêm: Vẽ biểu đồ số hàng thay vì giá trị trong Excel (với Easy Các bước)
BƯỚC 2: Tính giá trị của vận tốc ban đầu
- Thứ hai, chúng ta cần tính giá trị của vận tốc ban đầu.
- Để làm được điều đó , chúng ta sẽ sử dụng phương trình của Michaelis Menten.
- Chọn Ô C5 và nhập công thức bên dưới:
=($F$5*B5)/(B5+$F$4)
Ở đây, Ô F5 chứa Km , Ô F4 lưu trữ V-max và Ô B5 lưu trữ Nồng độ cơ chất [S] .
- Sau đó, nhấn Enter và kéo Fill Handle xuống.
- Kết quả là bạn sẽ thấy Tốc độ tương ứng với Nồng độ .
Đọc thêm: Cách tạo biểu đồ từ dãy ô đã chọn trong Excel
BƯỚC 3: Vẽ đồ thị Michaelis Menten với vận tốc đã tính
- Để vẽ đồ thị, bạn cần chọn các giá trị của Nồng độ và
Tốc độ . - Ở đây, chúng tôi đã chọn phạm vi B4:C14 .
- Sau đó, chuyển đến tab Chèn và nhấp vào biểu tượng Chèn phân tán . Một trình đơn thả xuống sẽ xuất hiện.
- Chọn tùy chọn Phân tán với các đường mịn và điểm đánh dấu từ trình đơn thả xuống.
- Kết quả là bạn sẽ thấy biểu đồ trên trang tính.
- Sau khi thay đổi trục và tiêu đề biểu đồ, biểu đồ sẽ trông giống như hình bên dưới.
Đọc thêm: Cách Vẽ Đồ Thị Trong Excel Với Nhiều Trục Y (3 Tiện Dụng Cách)
BƯỚC 4: Xác định vận tốc ban đầu cùng với vận tốc quan sát được
- Trong BƯỚC 2 , chúng tôi đã tính vận tốc ban đầu bằng công thức. Trong trường hợp đó, chúng tôi không có giá trị tuyệt đối của Km và V-max . Ngoài ra, không có vận tốc quan sát được.
- Nếu bạn có Vận tốc quan sát được như tập dữ liệu bên dưới, bạn có thể tính vận tốc ban đầu cũng như các giá trị của Km và V-max .
- Tại thời điểm này, hãy chọn Ô D5 và nhập công thứcbên dưới:
=($C$17*B5)/(B5+$C$16)
- Nhấn Enter và kéo Fill Handle xuống.
BƯỚC 5: Tìm sự khác biệt giữa vận tốc được quan sát và vận tốc tính toán
- Sau khi tính vận tốc với Michaelis Phương trình Menten, chúng ta cần tìm sự khác biệt giữa vận tốc quan sát được và vận tốc tính toán.
- Vì mục đích đó, hãy chọn Ô E5 và nhập công thức bên dưới:
=C5-D5
- Bây giờ, hãy nhấn Enter và kéo xuống Fill Handle để xem kết quả.
BƯỚC 6: Tìm Tổng bình phương các hiệu
- Để tìm giá trị tốt nhất cho Km và V-max , chúng ta cần xác định tổng bình phương của các chênh lệch.
- Để làm như vậy, hãy chọn Ô E17 và nhập công thức bên dưới:
=SUMSQ(E5:E14)
Ở đây, chúng ta đã sử dụng hàm SUMSQ để tính tổng bình phương của hiệu.
- Nhấn Enter để xem kết quả.
- Đối với bes t của Km và V-max , Tổng bình phương hiệu số phải nhỏ nhất.
BƯỚC 7: Vẽ đồ thị Menten Michaelis với cả đồ thị được quan sát & Vận tốc được tính toán
- Để vẽ biểu đồ có cả vận tốc được quan sát và được tính toán, hãy chọn dải B4:D14 .
- Sau đó, chuyển đến tab Chèn và nhấp vào ChènBiểu tượng phân tán. Một trình đơn thả xuống sẽ xuất hiện.
- Chọn tùy chọn Phân tán với các đường mịn và điểm đánh dấu từ trình đơn thả xuống.
- Kết quả là bạn sẽ thấy biểu đồ của cả vận tốc Quan sát được và Tính toán .
Đọc thêm: Cách vẽ nhiều đường trong một biểu đồ trong Excel
BƯỚC 8: Tìm hằng số Michaelis Menten và V-max
- Để tìm Km và V-max cho các giá trị quan sát được, chúng ta cần tính giá trị nhỏ nhất của tổng bình phương các hiệu.
- Đối với cho mục đích đó, chúng ta cần có sự trợ giúp của Phần bổ trợ bộ giải .
- Chuyển đến tab Dữ liệu và nhấp vào Bộ giải tùy chọn từ phần Phân tích .
- Nếu không tìm thấy Phần bổ trợ bộ giải , thì bạn có thể truy cập vào liên kết này .
- Trong hộp Tham số bộ giải , hãy nhập ô chứa giá trị Tổng bình phương của các hiệu trong trường Đặt mục tiêu . Trong trường hợp của chúng tôi, đó là Ô E17 .
- Sau đó, chọn Tối thiểu .
- Sau đó, nhập các ô chứa giá trị của Km và V-max trong trường “ Bằng cách thay đổi các ô có thể thay đổi ”.
- Ở đây, chúng tôi đã nhập $C$16: $C$17 .
- Nhấp vào Giải quyết để tiếp tục.
- Trong bước tiếp theo, nhấp vào OK để tiếp tục.
- Cuối cùng, bạnsẽ tìm thấy kết quả mong muốn như hình bên dưới.
BƯỚC 9: Chèn một nửa giá trị V-max vào biểu đồ
- Để chèn Half V-max , bạn cần tạo một biểu đồ như hình bên dưới.
- Ở đây, Ô B20 lưu trữ 0 . Ngoài ra, Ô B21 và Ô B22 lưu trữ giá trị của Km .
- Mặt khác, Ô C20 và Ô 21 chứa giá trị Half V-max . Điều đó có nghĩa là, C17/2 . Và Ô C22 lưu trữ 0 .
- Sau khi tạo Half V-max , chọn biểu đồ và phải – nhấp vào trên đó. Một menu sẽ xuất hiện.
- Nhấp vào tùy chọn Chọn dữ liệu từ đó.
- Sau đó, chọn Thêm từ hộp Chọn nguồn dữ liệu .
- Sau đó, chọn Tên sê-ri , Giá trị X và Giá trị Y .
- Ở đây, Ô 19 là Tên sê-ri , phạm vi B20:B22 là giá trị X và phạm vi C20:C22 là giá trị Y – .
- Sau khi chèn các giá trị, hãy nhấp vào OK .
- Một lần nữa, nhấp vào OK trong hộp Chọn nguồn dữ liệu .
- Kết quả là bạn sẽ thấy một biểu đồ như hình bên dưới.
Đọc thêm: Cách tạo biểu đồ từ bảng trong Excel (5 cách phù hợp)
BƯỚC 10: Thay đổi loại biểu đồ chuỗi
- Cuối cùng, chúng tôicần thay đổi loại biểu đồ cho biểu đồ giá trị Half V-max .
- Để làm như vậy, trước tiên hãy chọn biểu đồ giá trị Half V-max , sau đó, phải – nhấp vào nó. Một menu sẽ xuất hiện.
- Chọn Thay đổi loại biểu đồ chuỗi từ đó.
- Trong Thay đổi hộp Loại biểu đồ , thay đổi Loại biểu đồ của biểu đồ Giá trị một nửa V-max thành Phân tán bằng Đường thẳng và Điểm đánh dấu .
- Sau đó, nhấp vào OK .
Kết quả cuối cùng
- Cuối cùng, bạn sẽ nhận được điểm mong muốn tại đó Km là 9.1 15 và V-max là 7.328 .
Kết luận
Trong bài viết này, chúng tôi đã trình bày các quy trình từng bước để Vẽ đồ thị Michaelis Menten trong Excel . Tôi hy vọng bài viết này sẽ giúp bạn thực hiện công việc của mình một cách hiệu quả. Hơn nữa, chúng tôi cũng đã thêm sách thực hành ở đầu bài viết. Để kiểm tra kỹ năng của bạn, bạn có thể tải về để luyện tập. Ngoài ra, bạn có thể truy cập trang web ExcelWIKI để biết thêm các bài viết như thế này. Cuối cùng, nếu bạn có bất kỳ đề xuất hoặc thắc mắc nào, vui lòng hỏi trong phần bình luận bên dưới.