Inhoudsopgave
In dit artikel zullen we leren om Michaelis Menten grafiek uitzetten in Excel We gebruiken de Michaelis Menten vergelijking Over het algemeen wordt het gebruikt om de kinetische gegevens van enzymen te analyseren. Het verklaart het effect van de substraatconcentratie op enzymen. Vandaag zullen we stap-voor-stap procedures laten zien om Michaelis Menten's grafiek in Excel te plotten. We zullen ook leren om de waarde van de Michaelis Menten constante te extraheren. Laten we dus zonder verder oponthoud beginnen met de discussie.
Download Praktijk werkboek
U kunt het oefenwerkboek hier downloaden.
Michaelies-Menten Grafiek.xlsxWat is Michaelis Menten Grafiek?
In de Michaelis Menten-grafiek tekenen we de Reactiesnelheid (V) op de Y - as en de Substraatconcentratie ([S]) op de X - as De grafiek volgt de onderstaande vergelijking:
V = (Vmax*[S])/([S]+Km)
Het is een nul-orde vergelijking.
Hier,
V = beginsnelheid van de reactie
Vmax = Maximale snelheid van de reactie
[S] = Concentratie van het substraat
Km = Michaelis Menten Constante
Bij een lage substraatconcentratie wordt de vergelijking:
V = (Vmax*[S])/Km
Het is een eerste orde vergelijking.
Stap-voor-stap procedures om Michaelis Menten grafiek te tekenen in Excel
Om de stappen uit te leggen, gebruiken we een dataset die het volgende bevat Substraatconcentratie, [S] We berekenen de Reactiesnelheid (V) met de Michaelis Menten vergelijking. In het begin zullen we opgeleide waarden van Km en V-max Later zullen we de waarde van Km en V-max met behulp van de waargenomen en berekende Snelheid Laten we de volgende stappen doorlopen om te leren hoe de grafiek van Michaelis Menten moet worden uitgezet.
STAP 1: Michaelis Menten's Constant en V-max waarden invoegen
- In de eerste plaats moet u opgeleide waarden van Km en V-max .
- Laat, de waarden van Km en V-max zijn 10 .
- Hier hebben we ingevoegd 10 in beide Cel F4 en Cel F5 .
Lees meer: Rijenummer in plaats van waarde uitzetten in Excel (met eenvoudige stappen)
STAP 2: Bereken de waarde van de beginsnelheid
- Ten tweede moeten we de waarde van de beginsnelheid berekenen.
- Daarvoor gebruiken we de vergelijking van Michaelis Menten.
- Selecteer Cel C5 en typ de onderstaande formule in:
=($F$5*B5)/(B5+$F$4)
Hier, Cel F5 bevat Km , Cel F4 winkels V-max en Cel B5 slaat de Substraatconcentratie [S] .
- Druk daarna op Ga naar en sleep de Vulgreep naar beneden.
- Als gevolg daarvan ziet u de Snelheid die overeenkomt met de Concentratie .
Lees meer: Een grafiek maken van een geselecteerd bereik van cellen in Excel
STAP 3: Michaelis Menten grafiek met berekende snelheid uitzetten
- Om de grafiek uit te zetten, moet u de waarden van Concentratie en bijbehorende Snelheid .
- Hier hebben wij de bereik B4:C14 .
- Ga daarna naar de Plaats tabblad en klik op de Scatter invoegen Een drop-down menu verschijnt.
- Selecteer Strooien met vloeiende lijnen en markers optie uit het drop-down menu.
- Als gevolg daarvan ziet u de plot op het blad.
- Na het wijzigen van de assen en grafiektitels ziet de grafiek eruit zoals in onderstaande afbeelding.
Lees meer: Hoe grafiek uitzetten in Excel met meerdere Y-assen (3 handige manieren)
STAP 4: Bepaal de beginsnelheid samen met de waargenomen snelheid
- In STAP 2 berekenden we de beginsnelheid met een formule. In dat geval hadden we geen absolute waarden van Km en V-max Ook was er geen waargenomen snelheid.
- Als u Waargenomen snelheid zoals de dataset hieronder, kunt u de beginsnelheid berekenen evenals de waarden van Km en V-max .
- Selecteer op dit moment Cel D5 en typ de onderstaande formule in:
=($C$17*B5)/(B5+$C$16)
- Druk op Ga naar en sleep de Vulgreep naar beneden.
STAP 5: Zoek het verschil tussen de waargenomen en de berekende snelheid
- Na berekening van de snelheid met de Michaelis Menten-vergelijking moeten we het verschil vinden tussen de waargenomen en de berekende snelheid.
- Selecteer daartoe Cel E5 en typ de onderstaande formule in:
=C5-D5
- Druk nu op Ga naar en sleep de Vulgreep om de resultaten te zien.
STAP 6: Bereken de som van de kwadraten van de verschillen
- Om de beste waarden te vinden voor Km en V-max moeten we de som van de kwadraten van de verschillen bepalen.
- Selecteer daartoe Cel E17 en typ de onderstaande formule in:
=SUMSQ(E5:E14)
Hier hebben wij gebruik gemaakt van de SUMSQ-functie om de som van de kwadraten van de verschillen te berekenen.
- Druk op Ga naar om het resultaat te zien.
- Voor de beste waarden van Km en V-max de Som van de kwadraten van de verschillen moet minimaal zijn.
STAP 7: Michaelis Menten grafiek uitzetten met zowel waargenomen & berekende snelheden
- Om de grafiek met zowel de waargenomen als de berekende snelheden uit te zetten, selecteert u de optie bereik B4:D14 .
- Ga daarna naar de Plaats tabblad en klik op de Scatter invoegen Een drop-down menu verschijnt.
- Selecteer Strooien met vloeiende lijnen en markers optie uit het drop-down menu.
- Als gevolg daarvan ziet u de grafiek van beide Waargenomen en Berekend snelheden.
Lees meer: Hoe meerdere lijnen uitzetten in één grafiek in Excel
STAP 8: Vind de Constante van Michaelis Menten en V-max.
- Te vinden Km en V-max voor de waargenomen waarden, moeten we de minimumwaarde van de som van de kwadraten van de verschillen berekenen.
- Daarvoor moeten we de hulp inroepen van de Oplosser-invoegtoepassing .
- Ga naar de Gegevens tabblad en klik op de Oplosser optie van de Analyse sectie.
- Als u de Oplosser-invoegtoepassing dan kun je bezoek deze link .
- In de Solverparameters vak, typ de cel die de waarde bevat van Som van de kwadraten van de verschillen in de Doelstelling bepalen veld. In ons geval is dat Cel E17 .
- Selecteer vervolgens Min .
- Daarna typt u de cellen die de waarden bevatten van Km en V-max in de " Door variabele cellen te veranderen " veld.
- Hier hebben we getypt $C$16:$C$17 .
- Klik op Oplossen om door te gaan.
- In de volgende stap klikt u op OK om verder te gaan.
- Uiteindelijk zult u de gewenste resultaten vinden zoals de afbeelding hieronder.
STAP 9: Voeg de halve V-max waarde in de grafiek in.
- Om de Halve V-max waarde, moet u een grafiek maken zoals de afbeelding hieronder.
- Hier, Cel B20 winkels 0 . Ook, Cel B21 en Cel B22 de waarde van Km .
- Aan de andere kant, Cel C20 en Cel 21 bevatten de Halve V-max waarde. Dat betekent, C17/2 . en Cel C22 winkels 0 .
- Na het aanmaken van de Halve V-max tabel, selecteer de grafiek en rechts - klik Er verschijnt een menu.
- Klik op de Selecteer gegevens optie van daar.
- Selecteer vervolgens Toevoegen van de Selecteer gegevensbron doos.
- Selecteer vervolgens de Naam van de serie , X-waarden en Y-waarden .
- Hier, Cel 19 is de Naam van de serie , reeks B20:B22 is de X-waarden en reeks C20:C22 is de Y - waarden .
- Nadat u de waarden hebt ingevoegd, klikt u op OK .
- Nogmaals, klik OK in de Selecteer gegevensbron doos.
- Het resultaat is een grafiek zoals in de onderstaande afbeelding.
Lees meer: Een grafiek maken van een tabel in Excel (5 geschikte manieren)
STAP 10: Seriegrafiektype wijzigen
- Tenslotte moeten we het grafiektype voor de Halve V-max waarde grafiek.
- Selecteer daartoe de Halve V-max waarde grafiek eerst en dan, rechts - klik Er verschijnt een menu.
- Selecteer Type grafiek wijzigen vanaf daar.
- In de Grafiektype wijzigen box, verander de Grafiektype van de Halve V-max waarde grafiek naar Strooien met rechte lijnen en markers .
- Klik dan op OK .
Definitieve output
- Uiteindelijk krijg je het gewenste punt waar Km is 9.1 15 en V-max is 7.328 .
Conclusie
In dit artikel hebben we stap-voor-stap procedures gedemonstreerd om Michaelis Menten grafiek uitzetten in Excel Ik hoop dat dit artikel u zal helpen om uw taken efficiënt uit te voeren. Verder hebben we ook het oefenboek aan het begin van het artikel toegevoegd. Om uw vaardigheden te testen, kunt u het downloaden om te oefenen. Ook kunt u een bezoek brengen aan de ExcelWIKI website Tot slot, als je suggesties of vragen hebt, voel je vrij om ze te stellen in de commentaarsectie hieronder.