Innehållsförteckning
I den här artikeln får vi lära oss att rita Michaelis Menten-grafiken i Excel Vi använder oss av Michaelis Menten-ekvation för att plotta grafen. Generellt används den för att analysera enzymernas kinetiska data. Den förklarar effekten av substratkoncentrationen på enzymerna. I dag kommer vi att visa steg-för-steg-förfaranden för att plotta Michaelis Menten-grafen i Excel. Vi kommer också att lära oss att ta fram värdet på Michaelis Menten-konstanten. Så, utan ytterligare dröjsmål, låt oss börja diskussionen.
Ladda ner övningsboken
Du kan ladda ner övningsboken här.
Michaelies-Menten-grafiken.xlsxVad är Michaelis Menten-grafen?
I Michaelis Menten-grafen plottar vi Reaktionshastighet (V) på den Y - axel och Koncentration av substrat ([S]) på den X - axel Grafen följer ekvationen nedan:
V = (Vmax*[S])/([S]+Km)
Det är en nollordningsekvation.
Här,
V = Reaktionens utgångshastighet
Vmax = Maximal reaktionshastighet
[S] = koncentration av substrat
Km = Michaelis Menten-konstant
Vid låg substratkoncentration blir ekvationen:
V = (Vmax*[S])/Km
Det är en första ordningens ekvation.
Steg-för-steg-förfaranden för att plotta Michaelis Menten-grafiken i Excel
För att förklara stegen använder vi ett dataset som innehåller Koncentration av substrat, [S] Vi kommer att beräkna Reaktionshastighet (V) med Michaelis Menten-ekvationen. I början kommer vi att använda utbildade värden för Km och V-max Senare kommer vi att hitta värdet på Km och V-max med hjälp av de observerade och beräknade Hastighet Så låt oss gå igenom följande steg för att lära oss hur man ritar upp Michaelis Menten-grafen.
STEG 1: Lägg in Michaelis Menten-konstant och V-max-värden
- I första hand måste du infoga utbildade värden för Km och V-max .
- Låt, värdena för Km och V-max är 10 .
- Här har vi infört följande 10 i både Cell F4 och Cell F5 .
Läs mer: Plotta radnummer i stället för värde i Excel (med enkla steg)
STEG 2: Beräkna värdet av utgångshastigheten
- För det andra måste vi beräkna värdet på den ursprungliga hastigheten.
- För att göra det använder vi Michaelis Menten-ekvationen.
- Välj Cell C5 och skriv in formeln nedan:
=($F$5*B5)/(B5+$F$4)
Här, Cell F5 innehåller Km , Cell F4 butiker V-max , och Cell B5 lagrar den Koncentration av substrat [S] .
- Därefter trycker du på Gå in på och dra i Handtag för fyllning ner.
- Som ett resultat av detta kommer du att se Hastighet som motsvarar den Koncentration .
Läs mer: Hur man skapar ett diagram från ett valt intervall av celler i Excel
STEG 3: Plotta Michaelis Menten-grafen med beräknad hastighet
- För att rita grafen måste du välja värdena för Koncentration och motsvarande Hastighet .
- Här har vi valt den intervall B4:C14 .
- Gå därefter till Infoga och klicka på fliken Infoga spridning ikonen. En rullgardinsmeny visas.
- Välj Spridning med släta linjer och markörer från rullgardinsmenyn.
- Som ett resultat av detta kommer du att se en ritning på arket.
- När du har ändrat axel- och diagramtitlarna ser diagrammet ut som i bilden nedan.
Läs mer: Hur man plottar diagram i Excel med flera Y-axlar (3 praktiska sätt)
STEG 4: Bestäm den ursprungliga hastigheten tillsammans med den observerade hastigheten.
- På STEG 2 beräknade vi den ursprungliga hastigheten med en formel. I det fallet hade vi inga absoluta värden för Km och V-max Det fanns heller ingen observerad hastighet.
- Om du har Observerad hastighet som i datasetet nedan, kan du beräkna den ursprungliga hastigheten samt värdena för Km och V-max .
- Välj i det här ögonblicket Cell D5 och skriv in formeln nedan:
=($C$17*B5)/(B5+$C$16)
- Tryck på Gå in på och dra i Handtag för fyllning ner.
STEG 5: Hitta skillnaden mellan observerade och beräknade hastigheter
- Efter att ha beräknat hastigheten med Michaelis-Menten-ekvationen måste vi hitta skillnaden mellan den observerade och den beräknade hastigheten.
- För detta ändamål väljer du Cell E5 och skriv in formeln nedan:
=C5-D5
- Tryck nu på Gå in på och dra ner den Handtag för fyllning för att se resultaten.
STEG 6: Hitta summan av kvadraten av skillnaderna
- För att hitta de bästa värdena för Km och V-max Vi måste bestämma summan av skillnaderna i kvadrat.
- För att göra det väljer du Cell E17 och skriv in formeln nedan:
=SUMSQ(E5:E14)
Här har vi använt oss av funktionen SUMSQ för att beräkna summan av skillnaderna i kvadrat.
- Tryck på Gå in på för att se resultatet.
- För de bästa värdena för Km och V-max , den Summa av kvadrater av skillnader måste vara minst.
STEG 7: Plotta Michaelis Menten-grafen med både observerade och beräknade hastigheter.
- Om du vill visa grafen med både observerade och beräknade hastigheter väljer du intervall B4:D14 .
- Gå därefter till Infoga och klicka på fliken Infoga spridning ikonen. En rullgardinsmeny visas.
- Välj Spridning med släta linjer och markörer från rullgardinsmenyn.
- Som ett resultat kommer du att se grafen för både Observerad och Beräknad hastigheter.
Läs mer: Hur man plottar flera linjer i en graf i Excel
STEG 8: Hitta Michaelis Mentens konstant och V-max
- Att hitta Km och V-max för de observerade värdena måste vi beräkna det lägsta värdet av summan av skillnaderna i kvadrat.
- För det ändamålet behöver vi ta hjälp av den Tillägg till Solver .
- Gå till Uppgifter och klicka på fliken Lösare från alternativet Analys sektion.
- Om du inte hittar den Tillägg till Solver kan du Besök den här länken. .
- I Parametrar för lösaren den cell som innehåller värdet för Summa av kvadrater av skillnader i den Fastställa mål fältet. I vårt fall är det Cell E17 .
- Välj sedan Min .
- Därefter skriver du de celler som innehåller värdena för Km och V-max i " Genom att ändra variabla celler ".
- Här har vi skrivit $C$16:$C$17 .
- Klicka på Lös för att fortsätta.
- I följande steg klickar du på OK att gå vidare.
- Till slut får du det önskade resultatet som i bilden nedan.
STEG 9: Infoga halva V-max-värdet i diagrammet
- För att sätta in Halva V-max värde måste du skapa ett diagram som bilden nedan.
- Här, Cell B20 butiker 0 . också, Cell B21 och Cell B22 lagra värdet av Km .
- Å andra sidan, Cell C20 och Cell 21 innehåller följande Halva V-max värde. Det betyder, C17/2 . och Cell C22 butiker 0 .
- Efter att ha skapat Halva V-max tabellen, välj grafen och höger - Klicka på på den. En meny visas.
- Klicka på Välj data alternativet därifrån.
- Välj sedan Lägg till från Välj datakälla box.
- Välj sedan Namn på serien , X-värden , och Y-värden .
- Här, Cell 19 är den Namn på serien , intervall B20:B22 är den X-värden , och intervall C20:C22 är den Y - värden .
- När du har lagt in värdena klickar du på OK .
- Klicka igen på OK i den Välj datakälla box.
- Som ett resultat kommer du att se ett diagram som bilden nedan.
Läs mer: Hur man gör en graf från en tabell i Excel (5 lämpliga sätt)
STEG 10: Ändra typ av seriediagram
- Slutligen måste vi ändra diagramtypen för Halva V-max värdegraf.
- För att göra det väljer du Halva V-max värdegraf först och sedan, höger - Klicka på på den. En meny visas.
- Välj Ändra typ av seriediagram därifrån.
- I Ändra diagramtyp ändra rutan Typ av diagram av den Halva V-max Värde graf till Spridning med raka linjer och markörer .
- Klicka sedan på OK .
Slutligt resultat
- I slutändan kommer du att få den önskade punkten där Km är 9.1 15 och V-max är 7.328 .
Slutsats
I den här artikeln har vi visat steg-för-steg-förfaranden för att Plotta Michaelis Menten-grafiken i Excel Jag hoppas att den här artikeln hjälper dig att utföra dina uppgifter på ett effektivt sätt. Dessutom har vi lagt till övningsboken i början av artikeln. Om du vill testa dina färdigheter kan du ladda ner den för att träna. Du kan också besöka webbplatsen ExcelWIKI Om du har några förslag eller frågor är du välkommen att ställa dem i kommentarsfältet nedan.