فهرست مطالب
در این مقاله، ما یاد خواهیم گرفت که نمودار Michaelis Menten را در اکسل ترسیم کنیم . ما از معادله مایکلیس منتن برای رسم نمودار استفاده می کنیم. به طور کلی، برای تجزیه و تحلیل داده های جنبشی آنزیم ها استفاده می شود. این اثر غلظت سوبسترا بر روی آنزیم ها را توضیح می دهد. امروز، مراحل گام به گام را برای رسم نمودار Michaelis Menten در اکسل نشان خواهیم داد. ما همچنین یاد خواهیم گرفت که مقدار ثابت Michaelis Menten را استخراج کنیم. بنابراین، بدون تاخیر بیشتر، اجازه دهید بحث را شروع کنیم.
دانلود کتاب تمرین تمرین
می توانید کتاب تمرین تمرین را از اینجا دانلود کنید.
Michaelies-Menten Graph.xlsx
نمودار Michaelis Menten چیست؟
در نمودار Michaelis Menten، سرعت واکنش (V) روی Y - محور و غلظت بستر رسم می‌کنیم. ([S]) در X – محور . نمودار از معادله زیر پیروی می کند:
V = (Vmax*[S])/([S]+Km) این یک معادله مرتبه صفر است.
در اینجا،
V = سرعت اولیه واکنش
Vmax = حداکثر سرعت واکنش
[S] = غلظت زیرلایه
Km = Michaelis Menten Constant
در غلظت کم بستر، معادله تبدیل می شود:
V = (Vmax*[S])/Km این یک معادله مرتبه اول است.
روش های گام به گام برای ترسیم نمودار Michaelis Menten در اکسل
برای توضیح مراحل، از مجموعه داده ای استفاده خواهیم کرد که حاوی Substrate است. تمرکز، [S] . ما خواهیم کرد سرعت واکنش (V) را با معادله Michaelis Menten محاسبه کنید. در ابتدا از مقادیر آموزش داده شده Km و V-max استفاده خواهیم کرد. بعداً مقدار Km و V-max را با استفاده از سرعت مشاهده شده و محاسبه شده پیدا خواهیم کرد. بنابراین، بیایید مراحل زیر را طی کنیم تا روش ترسیم نمودار Michaelis Menten را بیاموزیم.
مرحله 1: مقادیر ثابت و V-max Michaelis Menten را وارد کنید
- در وهله اول، شما باید مقادیر آموزشی Km و V-max را وارد کنید.
- Let، مقادیر Km و V-max 10 هستند.
- در اینجا، 10 را در هر دو سلول F4 و سلول F5 .
بیشتر بخوانید: رسم شماره ردیف به جای مقدار در اکسل (با Easy مراحل)
مرحله 2: محاسبه مقدار سرعت اولیه
- ثانیا، ما باید مقدار سرعت اولیه را محاسبه کنیم.
- برای انجام این کار ما از معادله Michaelis Menten استفاده خواهیم کرد.
- Cell C5 را انتخاب کنید و فرمول زیر را تایپ کنید:
=($F$5*B5)/(B5+$F$4) 
در اینجا، Cell F5 شامل Km ، Cell F4 ذخیره V-max و Cell B5 غلظت بستر [S] را ذخیره می کند.
- پس از آن، Enter را فشار دهید و را بکشید Fill Handle پایین.
- در نتیجه، سرعت مربوط به تمرکز .
بیشتر بخوانید: نحوه ایجاد نمودار از محدوده انتخابی سلولها در اکسل
مرحله 3: نمودار Michaelis Menten را با سرعت محاسبه شده ترسیم کنید
- برای رسم نمودار، باید مقادیر تمرکز و مربوط به <را انتخاب کنید. 1>سرعت .
- در اینجا، محدوده B4:C14 را انتخاب کرده ایم.
- پس از آن، به تب Insert بروید و روی نماد Insert Scatter کلیک کنید. یک منوی کشویی ظاهر می شود.
- گزینه Scatter with Smooth Lines and Markers را از منوی کشویی انتخاب کنید.
- در نتیجه نمودار را روی برگه خواهید دید.
- پس از تغییر عنوان محور و نمودار، نمودار مانند تصویر زیر خواهد بود.
بیشتر بخوانید: نحوه رسم نمودار در اکسل با چند محور Y (3 Handy راهها)
مرحله 4: سرعت اولیه را به همراه سرعت مشاهده شده تعیین کنید
- در گام 2 ، سرعت اولیه را با یک فرمول محاسبه کردیم. در آن حالت، ما مقادیر مطلق Km و V-max نداشتیم. همچنین، هیچ سرعت مشاهده‌ای وجود نداشت.
- اگر سرعت مشاهده شده مانند مجموعه داده زیر دارید، می‌توانید سرعت اولیه و همچنین مقادیر Km و V-max .
- در این لحظه، Cell D5 را انتخاب کنید و فرمول را تایپ کنیددر زیر:
=($C$17*B5)/(B5+$C$16) 
- فشار دهید Enter و بکشید دستگیره را پر کنید پایین.
مرحله 5: تفاوت بین سرعت مشاهده شده و محاسبه شده را پیدا کنید
- بعد از محاسبه سرعت با میکائیلیس معادله منتن، ما باید تفاوت بین سرعت مشاهده شده و محاسبه شده را پیدا کنیم.
- برای این منظور، Cell E5 را انتخاب کنید و فرمول زیر را تایپ کنید:
=C5-D5 
- اکنون، Enter را فشار دهید و Fill Handle را به پایین بکشید تا نتایج.
مرحله 6: یافتن مجموع مربع تفاوت ها
- برای یافتن بهترین مقادیر برای Km و V-max ، باید مجموع مربعات تفاوت ها را تعیین کنیم.
- برای این کار، Cell E17 را انتخاب کنید و فرمول زیر را تایپ کنید:
=SUMSQ(E5:E14) 
در اینجا، ما از تابع SUMSQ استفاده کرده ایم. برای محاسبه مجموع مجذورهای تفاوت ها.
- برای مشاهده نتیجه Enter را فشار دهید.
- برای bes t مقادیر Km و V-max ، مجموع مجذورات تفاوت باید حداقل باشد.
مرحله 7: نمودار Michaelis Menten را با هر دو مشاهده شده ترسیم کنید. سرعت های محاسبه شده
- برای رسم نمودار با سرعت مشاهده شده و محاسبه شده، محدوده B4:D14 را انتخاب کنید.
- پس از آن، به تب Insert بروید و بر روی Insert کلیک کنید.نماد پراکندگی . یک منوی کشویی ظاهر می شود.
- گزینه Scatter with Smooth Lines and Markers را از منوی کشویی انتخاب کنید.
- در نتیجه، نمودار هر دو سرعت مشاهده شده و محاسبه شده را خواهید دید.
بیشتر بخوانید: نحوه رسم چندین خط در یک نمودار در اکسل
مرحله 8: Constant و V-max Michaelis Menten را پیدا کنید
- برای یافتن Km و V-max برای مقادیر مشاهده شده، باید حداقل مقدار مجموع مجذورات تفاوت ها را محاسبه کنیم.
- برای برای این منظور، باید از Solver Add-in کمک بگیریم.
- به برگه Data بروید و روی Solver کلیک کنید. گزینه از بخش Analysis .
- اگر Solver Add-in را پیدا نکردید، می توانید از این پیوند دیدن کنید .
- در کادر Solver Parameters ، سلولی را تایپ کنید که حاوی مقدار مجموع مربعات تفاوت ها <2 است>در قسمت Set Objective . در مورد ما، Cell E17 است.
- سپس، Min را انتخاب کنید.
- پس از آن، سلول هایی را که حاوی مقادیر <هستند تایپ کنید. 1>Km و V-max در قسمت " By Changing Variable Cells ".
- در اینجا، $C$16 را تایپ کرده ایم: $C$17 .
- برای ادامه روی حل کلیک کنید.
- در مرحله زیر، برای حرکت به جلو، OK را کلیک کنید.
- در نهایت، شمانتایج مورد نظر را مانند تصویر زیر پیدا خواهید کرد.
مرحله 9: مقدار نیم V-max را در نمودار وارد کنید
- برای درج مقدار Half V-max ، باید نموداری مانند تصویر زیر ایجاد کنید.
- در اینجا، Cell B20 0 را ذخیره می کند. همچنین، Cell B21 و Cell B22 مقدار Km را ذخیره می کنند.
- از سوی دیگر، Cell C20 و سلول 21 حاوی مقدار Half V-max است. یعنی C17/2 . و Cell C22 ذخیره می کند 0 .
- پس از ایجاد Half V-max جدول، نمودار را انتخاب کنید و راست – روی آن کلیک کنید . یک منو ظاهر می شود.
- از آنجا روی گزینه Select Data کلیک کنید.
- سپس، انتخاب کنید را از کادر انتخاب منبع داده اضافه کنید.
- سپس، نام سری را انتخاب کنید. ، X-values و Y-values .
- در اینجا، سلول 19 نام سری<2 است>، محدوده B20:B22 X-values است و محدوده C20:C22 Y – مقادیر .
- بعد از درج مقادیر، OK را کلیک کنید.
- دوباره روی کلیک کنید. OK در کادر Select Data Source .
- در نتیجه، نموداری مانند تصویر خواهید دید. در زیر.
بیشتر بخوانید: نحوه ایجاد نمودار از جدول در اکسل (5 روش مناسب)
مرحله 10: تغییر نوع نمودار سری
- در نهایت، ماباید نوع نمودار را برای نیم V-max نمودار مقدار تغییر دهید.
- برای انجام این کار، ابتدا نمودار مقدار Half V-max و سپس، راست – روی آن کلیک کنید. یک منو ظاهر می شود.
- از آنجا تغییر نوع نمودار سری را انتخاب کنید.
- در <1 کادر نوع نمودار را تغییر دهید، نوع نمودار نمودار نیم V-max مقدار را به Scatter with Straightlines and Markers تغییر دهید.
- سپس، OK را کلیک کنید.
خروجی نهایی
- در پایان، شما دریافت خواهید کرد نقطه مورد نظر که در آن Km 9.1 15 و V-max 7.328 است. <14
نتیجه گیری
در این مقاله، روش های گام به گام ترسیم نمودار Michaelis Menten در اکسل را نشان داده ایم. امیدوارم این مقاله به شما کمک کند تا وظایف خود را به نحو احسن انجام دهید. علاوه بر این، کتاب تمرین را نیز در ابتدای مقاله اضافه کرده ایم. برای تست مهارت های خود، می توانید آن را برای تمرین دانلود کنید. همچنین، می توانید برای مقالات بیشتر از این دست به وب سایت ExcelWIKI مراجعه کنید. در آخر، اگر پیشنهاد یا سؤالی دارید، در بخش نظرات زیر بپرسید.
