U ovom ćemo članku naučiti crtati Michaelis Mentenov grafikon u Excelu . Koristimo jednadžbu Michaelisa Mentena za iscrtavanje grafa. Općenito, koristi se za analizu kinetičkih podataka enzima. Objašnjava učinak koncentracije supstrata na enzime. Danas ćemo pokazati korak po korak postupke za crtanje grafikona Michaelisa Mentena u Excelu. Također ćemo naučiti izdvojiti vrijednost konstante Michaelis Menten. Dakle, bez daljnjeg odgađanja, započnimo raspravu.

Preuzmite radnu bilježnicu za vježbe

Radnu bilježnicu za vježbe možete preuzeti ovdje.

Što je Michaelis Menten Graph?

Na grafikonu Michaelis Menten iscrtavamo Brzinu reakcije (V) na Y – osi i Koncentraciju supstrata ([S]) na X – osi . Grafikon slijedi donju jednadžbu:

To je jednadžba nultog reda.

Ovdje,

V = Početna brzina reakcije

Vmax = Maksimalna brzina reakcije

[S] = Koncentracija supstrata

Km = Michaelis Menten konstanta

Pri niskoj koncentraciji supstrata, jednadžba postaje:

To je jednadžba prvog reda.

Postupci korak po korak za iscrtavanje Michaelis Menten grafikona u Excelu

Da bismo objasnili korake, koristit ćemo skup podataka koji sadrži Supstrat Koncentracija, [S] . Hoćemoizračunajte Brzinu reakcije (V) pomoću jednadžbe Michaelis Menten. U početku ćemo koristiti obrazovane vrijednosti Km i V-max . Kasnije ćemo pronaći vrijednost Km i V-max koristeći promatranu i izračunatu Brzinu . Dakle, prođimo kroz sljedeće korake da naučimo kako iscrtati graf Michaelisa Mentena.

1. KORAK: Umetnite konstantu i V-max vrijednosti Michaelisa Mentena

• Na prvom mjestu trebate umetnuti obrazovane vrijednosti Km i V-max .
• Neka, vrijednosti Km i V-max su 10 .
• Ovdje smo umetnuli 10 i u ćeliju F4 i Ćelija F5 .

Pročitajte više: Iscrtavanje broja retka umjesto vrijednosti u Excelu (uz Easy Koraci)

KORAK 2: Izračunajte vrijednost početne brzine

• Drugo, moramo izračunati vrijednost početne brzine.
• Da bismo to učinili , koristit ćemo jednadžbu Michaelisa Mentena.
• Odaberite ćeliju C5 i upišite formulu u nastavku:

Ovdje, ćelija F5 sadrži Km , ćelija F4 pohranjuje V-max , a ćelija B5 pohranjuje Koncentraciju supstrata [S] .

• Nakon toga pritisnite Enter i povucite Ručka za punjenje dolje.

• Kao rezultat, vidjet ćete Brzinu koja odgovara Koncentracija .

Pročitajte više: Kako stvoriti grafikon iz odabranog raspona ćelija u Excelu

KORAK 3: Iscrtajte Michaelis Mentenov grafikon s izračunatom brzinom

• Za iscrtavanje grafikona trebate odabrati vrijednosti Koncentracije i odgovarajuće Brzina .
• Ovdje smo odabrali raspon B4:C14 .

• Nakon toga idite na karticu Insert i kliknite na ikonu Insert Scatter . Pojavit će se padajući izbornik.
• Odaberite opciju Scatter with Smooth Lines and Markers s padajućeg izbornika.

• Kao rezultat, vidjet ćete dijagram na listu.

• Nakon promjene osi i naslova grafikona, grafikon izgledat će kao na slici ispod.

Pročitajte više: Kako iscrtati grafikon u Excelu s više Y osi (3 zgodne Načini)

KORAK 4: Odredite početnu brzinu zajedno s opaženom brzinom

• U KORAKU 2 , izračunali smo početnu brzinu pomoću formule. U tom slučaju nismo imali apsolutne vrijednosti Km i V-max . Također, nije bilo opažene brzine.
• Ako imate Opaženu brzinu kao na skupu podataka u nastavku, možete izračunati početnu brzinu kao i vrijednosti Km i V-max .

• U ovom trenutku odaberite ćeliju D5 i upišite formuluispod:

• Pritisnite Enter i povucite Ručka za punjenje dolje.

KORAK 5: Pronađite razliku između promatranih i izračunatih brzina

• Nakon izračuna brzine pomoću Michaelisa U skladu s jednadžbom, moramo pronaći razliku između opažene i izračunate brzine.
• U tu svrhu odaberite ćeliju E5 i upišite formulu u nastavku:

• Sada pritisnite Enter i povucite prema dolje Ručku za punjenje da vidite rezultati.

KORAK 6: Pronađite zbroj kvadrata razlika

• Da biste pronašli najbolje vrijednosti za Km i V-max , moramo odrediti zbroj kvadrata razlika.
• Da biste to učinili, odaberite ćeliju E17 i upišite formulu u nastavku:

Ovdje smo koristili funkciju SUMSQ za izračunavanje zbroja kvadrata razlika.

• Pritisnite Enter da vidite rezultat.
• Za bes t vrijednosti Km i V-max , Zbroj kvadrata razlike mora biti minimalan.

KORAK 7: Iscrtajte Michaelis Mentenov graf s oba promatrana & Izračunate brzine

• Za iscrtavanje grafikona s promatranim i izračunatim brzinama odaberite raspon B4:D14 .

• Nakon toga idite na karticu Umetni i kliknite na UmetniIkona raspršene oznake . Pojavit će se padajući izbornik.
• Odaberite opciju Scatter with Smooth Lines and Markers s padajućeg izbornika.

• Kao rezultat, vidjet ćete grafikon i Opaženih i Izračunatih brzina.

Pročitajte više: Kako iscrtati više linija u jednom grafikonu u Excelu

KORAK 8: Pronađite Michaelis Mentenovu konstantu i V-max

• Da bismo pronašli Km i V-max za promatrane vrijednosti, moramo izračunati minimalnu vrijednost zbroja kvadrata razlika.
• Za u tu svrhu trebamo uzeti pomoć Dodatka za rješavanje .
• Idite na karticu Podaci i kliknite na Solver opciju iz odjeljka Analiza .
• Ako ne pronađete Dodatak za rješavanje , možete posjetiti ovu vezu .

• U okvir Parametri rješavača upišite ćeliju koja sadrži vrijednost Zbroja kvadrata razlike u polju Postavi cilj . U našem slučaju to je ćelija E17 .
• Zatim odaberite Min .
• Nakon toga upišite ćelije koje sadrže vrijednosti Km i V-max u polju “ Promjenom varijabilnih ćelija ”.
• Ovdje smo upisali $C$16: $C$17 .
• Kliknite Riješi za nastavak.

• U sljedećem koraku, kliknite U redu za kretanje naprijed.

• Napokon, viće pronaći željene rezultate kao na slici ispod.

KORAK 9: Umetnite polovicu V-max vrijednosti u grafikon

• Za umetanje Half V-max vrijednost, trebate izraditi grafikon kao na slici ispod.
• Ovdje, ćelija B20 pohranjuje 0 . Također, ćelija B21 i ćelija B22 pohranjuju vrijednost Km .
• S druge strane, ćelija C20 i ćelija 21 sadrže vrijednost Half V-max . To znači, C17/2 . I ćelija C22 pohranjuje 0 .

• Nakon stvaranja Half V-max tablica, odaberite grafikon i desno – kliknite na njega. Pojavit će se izbornik.
• Kliknite tamo opciju Odaberi podatke .

• Zatim odaberite Dodajte iz okvira Odaberite izvor podataka .

• Zatim odaberite Naziv serije , X-vrijednosti i Y-vrijednosti .
• Ovdje, ćelija 19 je naziv serije , raspon B20:B22 je X-vrijednost , a raspon C20:C22 je Y – vrijednost .
• Nakon umetanja vrijednosti kliknite U redu .

• Opet kliknite U redu u okviru Odaberite izvor podataka .

• Kao rezultat, vidjet ćete grafikon poput slike u nastavku.

Pročitajte više: Kako napraviti grafikon iz tablice u Excelu (5 prikladnih načina)

KORAK 10: Promjena vrste serijskog grafikona

• Konačno, mimorate promijeniti vrstu grafikona za Half V-max graf vrijednosti.
• Da biste to učinili, prvo odaberite Half V-max graf vrijednosti, a zatim, desno – kliknite na njega. Pojavit će se izbornik.
• Odaberite Promijeni vrstu grafikona serije odatle.

• U Okvir Promjena vrste grafikona , promijenite Vrstu grafikona grafa Half V-max Value u Scatter with Straight Lines and Markers .
• Zatim kliknite OK .

Konačni rezultat

• Na kraju ćete dobiti željena točka gdje Km je 9,1 15 i V-max je 7,328 .

Zaključak

U ovom smo članku demonstrirali korak po korak postupke za iscrtavanje Michaelis Menten grafikona u Excelu . Nadam se da će vam ovaj članak pomoći da učinkovito obavljate svoje zadatke. Nadalje, dodali smo i praktičnu knjigu na početku članka. Kako biste testirali svoje vještine, možete ga preuzeti za vježbanje. Također, možete posjetiti web stranicu ExcelWIKI za više ovakvih članaka. Na kraju, ako imate bilo kakvih prijedloga ili pitanja, slobodno ih postavite u odjeljku za komentare ispod.