สารบัญ
ในบทความนี้ เราจะเรียนรู้วิธีการ พล็อตกราฟ Michaelis Menten ใน Excel เราใช้ สมการของไมเคิล เมนเทน ในการพล็อตกราฟ โดยทั่วไปจะใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลจลนศาสตร์ของเอนไซม์ อธิบายถึงผลกระทบของความเข้มข้นของสารตั้งต้นต่อเอนไซม์ วันนี้เราจะแสดงขั้นตอนทีละขั้นตอนในการพล็อตกราฟของ Michaelis Menten ใน Excel เราจะเรียนรู้ที่จะแยกค่าของค่าคงตัวของ Michaelis Menten ดังนั้น โดยไม่ชักช้า เรามาเริ่มการสนทนากันเลย
ดาวน์โหลดแบบฝึกหัด
คุณสามารถดาวน์โหลดแบบฝึกหัดได้จากที่นี่
Michaelies-Menten Graph.xlsx
Michaelis Menten Graph คืออะไร?
ในกราฟ Michaelis Menten เราพล็อต ความเร็วปฏิกิริยา (V) บนแกน Y – และ ความเข้มข้นของสารตั้งต้น ([S]) บนแกน X – กราฟเป็นไปตามสมการด้านล่างนี้:
V = (Vmax*[S])/([S]+Km)
มันเป็นสมการที่มีลำดับศูนย์
ตรงนี้
V = ความเร็วเริ่มต้นของปฏิกิริยา
Vสูงสุด = ความเร็วสูงสุดของปฏิกิริยา
[S] = ความเข้มข้นของสารตั้งต้น
Km = ค่าคงที่ Michaelis Menten
ที่ความเข้มข้นของสารตั้งต้นต่ำ สมการจะกลายเป็น:
V = (Vmax*[S])/Km
เป็นสมการอันดับหนึ่ง
ขั้นตอนทีละขั้นตอนในการพล็อตกราฟ Michaelis Menten ใน Excel
เพื่ออธิบายขั้นตอนต่างๆ เราจะใช้ชุดข้อมูลที่ประกอบด้วย Substrate ความเข้มข้น [S] . เราจะคำนวณ ความเร็วปฏิกิริยา (V) ด้วยสมการ Michaelis Menten ในการเริ่มต้น เราจะใช้ค่าการศึกษา Km และ V-max ต่อมา เราจะหาค่าของ Km และ V-max โดยใช้ ความเร็ว ที่สังเกตและคำนวณได้ ลองทำตามขั้นตอนต่อไปนี้เพื่อเรียนรู้วิธีการพล็อตกราฟของ Michaelis Menten
ขั้นตอนที่ 1: ใส่ค่าคงที่ของ Michaelis Menten และค่า V-max
- อันดับแรก คุณต้องใส่ค่าการศึกษา Km และ V-max .
- ปล่อยให้ ค่า Km และ V-max คือ 10 .
- ที่นี่ เราได้ใส่ 10 ในทั้ง เซลล์ F4 และ เซลล์ F5 .
อ่านเพิ่มเติม: การลงจุดหมายเลขแถวแทนค่าใน Excel (ด้วย Easy ขั้นตอน)
ขั้นตอนที่ 2: คำนวณค่าของความเร็วเริ่มต้น
- ประการที่สอง เราต้องคำนวณค่าของความเร็วเริ่มต้น
- ในการทำเช่นนั้น เราจะใช้สมการของ Michaelis Menten
- เลือก เซลล์ C5 แล้วพิมพ์สูตรด้านล่าง:
=($F$5*B5)/(B5+$F$4)
<0ที่นี่ เซลล์ F5 มี กม. เซลล์ F4 เก็บ V-max และ เซลล์ B5 เก็บ ความเข้มข้นของพื้นผิว [S] .
- หลังจากนั้น กด Enter แล้วลาก เติมแฮนเดิล ลง
- ดังนั้น คุณจะเห็น ความเร็ว ที่สอดคล้องกับ ความเข้มข้น .
อ่านเพิ่มเติม: วิธีสร้างแผนภูมิจากช่วงเซลล์ที่เลือกใน Excel
ขั้นตอนที่ 3: เขียนกราฟ Michaelis Menten ด้วยความเร็วที่คำนวณ
- ในการลงจุดกราฟ คุณต้องเลือกค่า ความเข้มข้น และ ความเร็ว .
- ที่นี่ เราได้เลือก ช่วง B4:C14 .
- หลังจากนั้น ไปที่แท็บ แทรก และคลิกที่ไอคอน แทรกกระจาย เมนูแบบเลื่อนลงจะปรากฏขึ้น
- เลือก กระจายด้วยเส้นเรียบและเครื่องหมาย ตัวเลือกจากเมนูแบบเลื่อนลง
- ดังนั้น คุณจะเห็นการลงจุดบนแผ่นงาน
- หลังจากเปลี่ยนชื่อแกนและแผนภูมิ กราฟ จะมีลักษณะดังภาพด้านล่าง
อ่านเพิ่มเติม: วิธีเขียนกราฟใน Excel ด้วยแกน Y หลายแกน (3 Handy วิธี)
ขั้นตอนที่ 4: กำหนดความเร็วเริ่มต้นพร้อมกับความเร็วที่สังเกตได้
- ใน ขั้นตอนที่ 2 เราคำนวณความเร็วเริ่มต้นด้วยสูตร ในกรณีนั้น เราไม่มีค่าสัมบูรณ์ของ กม. และ V-สูงสุด นอกจากนี้ยังไม่มีความเร็วที่สังเกตได้
- หากคุณมี ความเร็วที่สังเกตได้ เหมือนกับชุดข้อมูลด้านล่าง คุณสามารถคำนวณความเร็วเริ่มต้นรวมถึงค่าของ Km และ V-max .
- ในขณะนี้ ให้เลือก เซลล์ D5 แล้วพิมพ์สูตรด้านล่าง:
=($C$17*B5)/(B5+$C$16)
- กด Enter แล้วลาก เติมแฮนเดิล ลง
ขั้นตอนที่ 5: ค้นหาความแตกต่างระหว่างความเร็วที่สังเกตได้และความเร็วที่คำนวณได้
- หลังจากคำนวณความเร็วด้วยเครื่องมือ Michaelis ตามสมการ เราจำเป็นต้องค้นหาความแตกต่างระหว่างความเร็วที่สังเกตและความเร็วที่คำนวณได้
- เพื่อจุดประสงค์นั้น เลือก เซลล์ E5 และพิมพ์สูตรด้านล่าง:
=C5-D5
- ตอนนี้ กด Enter แล้วลาก Fill Handle ลงเพื่อดู ผลลัพธ์
ขั้นตอนที่ 6: หาผลรวมกำลังสองของผลต่าง
- เพื่อหาค่าที่ดีที่สุดสำหรับ Km และ V-max เราจำเป็นต้องหาผลรวมกำลังสองของผลต่าง
- โดยเลือก เซลล์ E17 แล้วพิมพ์สูตรด้านล่าง:
=SUMSQ(E5:E14)
ที่นี่ เราได้ใช้ ฟังก์ชัน SUMSQ เพื่อคำนวณผลบวกกำลังสองของผลต่าง
- กด Enter เพื่อดูผลลัพธ์
- For bes ค่า t ของ Km และ V-สูงสุด ผลรวมของผลต่างกำลังสอง จะต้องมีค่าน้อยที่สุด
ขั้นตอนที่ 7: พล็อตกราฟ Michaelis Menten พร้อมทั้งสองค่าที่สังเกตได้ & ความเร็วที่คำนวณได้
- หากต้องการพล็อตกราฟด้วยความเร็วทั้งที่สังเกตและคำนวณได้ เลือก ช่วง B4:D14 .
- หลังจากนั้น ไปที่แท็บ แทรก และคลิกที่แท็บ แทรกกระจาย ไอคอน เมนูแบบเลื่อนลงจะปรากฏขึ้น
- เลือก กระจายด้วยเส้นเรียบและเครื่องหมาย ตัวเลือกจากเมนูแบบเลื่อนลง
- ด้วยเหตุนี้ คุณจะเห็นกราฟของทั้ง ความเร็ว ที่สังเกตได้ และ ความเร็ว ที่คำนวณได้
อ่านเพิ่มเติม: วิธีลงจุดหลายเส้นในกราฟเดียวใน Excel
ขั้นตอนที่ 8: หาค่าคงที่ของ Michaelis Menten และ V-max
- ในการหา Km และ V-max สำหรับค่าที่สังเกตได้ เราจำเป็นต้องคำนวณค่าต่ำสุดของผลรวมกำลังสองของผลต่าง
- สำหรับ เพื่อจุดประสงค์นั้น เราต้องใช้ความช่วยเหลือจาก โปรแกรมเสริมโปรแกรมแก้ไข
- ไปที่แท็บ ข้อมูล และคลิกบนแท็บ โปรแกรมแก้ไข ตัวเลือกจากส่วน การวิเคราะห์
- หากคุณไม่พบ โปรแกรมเสริมโปรแกรมแก้ไข คุณสามารถ ไปที่ลิงก์นี้ .
- ในช่อง Solver Parameters พิมพ์เซลล์ที่มีค่า Sum of Squares of Difference ในฟิลด์ กำหนดวัตถุประสงค์ ในกรณีของเรา นั่นคือ เซลล์ E17 .
- จากนั้น เลือก ต่ำสุด .
- หลังจากนั้น พิมพ์เซลล์ที่มีค่าของ Km และ V-max ในฟิลด์ “ By Changing Variable Cells ”
- ที่นี่ เราได้พิมพ์ $C$16: $C$17 .
- คลิก แก้ปัญหา เพื่อดำเนินการต่อ
- ในขั้นตอนต่อไปนี้ คลิก ตกลง เพื่อดำเนินการต่อ
- สุดท้าย คุณจะพบผลลัพธ์ที่ต้องการดังภาพด้านล่าง
ขั้นตอนที่ 9: แทรกค่า Half V-max ในกราฟ
- เพื่อแทรก ค่า ครึ่ง V-สูงสุด คุณต้องสร้างแผนภูมิดังภาพด้านล่าง
- ที่นี่ เซลล์ B20 เก็บ 0 นอกจากนี้ เซลล์ B21 และ เซลล์ B22 เก็บค่าของ Km
- ในทางกลับกัน เซลล์ C20 และ เซลล์ 21 มีค่า ครึ่ง V-สูงสุด นั่นหมายความว่า C17/2 และ เซลล์ C22 เก็บ 0 .
- หลังจากสร้าง ครึ่ง V-สูงสุด ตาราง เลือกกราฟและ ขวา – คลิก บนกราฟนั้น เมนูจะปรากฏขึ้น
- คลิกที่ตัวเลือก เลือกข้อมูล จากที่นั่น
- จากนั้นเลือก เพิ่ม จากช่อง เลือกแหล่งข้อมูล
- จากนั้น เลือก ชื่อชุดข้อมูล , ค่า X และ ค่า Y .
- ที่นี่ เซลล์ 19 คือ ชื่อชุดข้อมูล , ช่วง B20:B22 คือ ค่า X และ ช่วง C20:C22 คือ Y – ค่า .
- หลังจากใส่ค่า คลิก ตกลง .
- อีกครั้ง คลิก ตกลง ในช่อง เลือกแหล่งข้อมูล
- ดังนั้น คุณจะเห็นกราฟดังภาพ ด้านล่าง
อ่านเพิ่มเติม: วิธีสร้างกราฟจากตารางใน Excel (5 วิธีที่เหมาะสม)
ขั้นตอนที่ 10: เปลี่ยนประเภทแผนภูมิซีรี่ส์
- สุดท้าย เราจำเป็นต้องเปลี่ยนประเภทแผนภูมิสำหรับกราฟค่า ครึ่ง V-สูงสุด
- โดยเลือกกราฟค่า ครึ่ง V-สูงสุด ก่อนแล้วจึง ขวา – คลิก บนนั้น เมนูจะปรากฏขึ้น
- เลือก เปลี่ยนประเภทแผนภูมิซีรีส์ จากนั้น
- ใน เปลี่ยนประเภทแผนภูมิ กล่อง เปลี่ยน ประเภทแผนภูมิ ของกราฟ ค่าครึ่ง V-สูงสุด เป็น กระจายด้วยเส้นตรงและเครื่องหมาย .
- จากนั้น คลิก ตกลง .
ผลลัพธ์สุดท้าย
- ในท้ายที่สุด คุณจะได้รับ จุดที่ต้องการโดย กม. เท่ากับ 9.1 15 และ V-max เท่ากับ 7.328 . <14
สรุป
ในบทความนี้ เราได้สาธิตขั้นตอนทีละขั้นตอนในการ เขียนกราฟ Michaelis Menten ใน Excel ฉันหวังว่าบทความนี้จะช่วยให้คุณทำงานได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ เรายังได้เพิ่มหนังสือแบบฝึกหัดไว้ที่ตอนต้นของบทความด้วย หากต้องการทดสอบทักษะของคุณ คุณสามารถดาวน์โหลดไปใช้แบบฝึกหัดได้ นอกจากนี้ คุณยังสามารถเยี่ยมชม เว็บไซต์ ExcelWIKI เพื่อดูบทความเพิ่มเติมในลักษณะนี้ สุดท้าย หากคุณมีคำแนะนำหรือข้อสงสัยใดๆ โปรดถามในส่วนความคิดเห็นด้านล่าง