Innholdsfortegnelse
I denne artikkelen skal vi lære å plotte Michaelis Menten-grafen i Excel . Vi bruker Michaelis Menten-ligningen for å plotte grafen. Vanligvis brukes det til å analysere de kinetiske dataene til enzymer. Den forklarer effekten av substratkonsentrasjon på enzymer. I dag vil vi vise steg-for-steg prosedyrer for å plotte Michaelis Mentens graf i Excel. Vi vil også lære å trekke ut verdien av Michaelis Menten-konstanten. Så, uten ytterligere forsinkelser, la oss starte diskusjonen.
Last ned øvelsesarbeidsbok
Du kan laste ned øvelsesarbeidsboken herfra.
Michaelies-Menten Graph.xlsx
Hva er Michaelis Menten-graf?
I Michaelis Menten-grafen plotter vi reaksjonshastigheten (V) på Y – aksen og substratkonsentrasjonen ([S]) på X – aksen . Grafen følger ligningen nedenfor:
V = (Vmax*[S])/([S]+Km)
Det er en nullordensligning.
Her,
V = Starthastighet for reaksjon
Vmax = Maksimal reaksjonshastighet
[S] = Konsentrasjon av substrat
Km = Michaelis Menten Konstant
Ved lav substratkonsentrasjon blir ligningen:
V = (Vmax*[S])/Km
Det er en førsteordens ligning.
Trinnvise prosedyrer for å plotte Michaelis Menten-graf i Excel
For å forklare trinnene vil vi bruke et datasett som inneholder Substrate Konsentrasjon, [S] . Vi vilberegne Reaksjonshastigheten (V) med Michaelis Menten-ligningen. I begynnelsen vil vi bruke opplærte verdier på Km og V-maks . Senere vil vi finne verdien av Km og V-maks ved å bruke den observerte og beregnede Hastigheten . Så la oss gå gjennom de følgende trinnene for å lære hvordan du plotter Michaelis Mentens graf.
TRINN 1: Sett inn Michaelis Mentens konstante og V-maks verdier
- For det første må du sette inn utdannede verdier Km og V-maks .
- La, verdiene Km og V-maks er 10 .
- Her har vi satt inn 10 i både Celle F4 og Celle F5 .
Les mer: Plotte radnummer i stedet for verdi i Excel (med Easy Trinn)
TRINN 2: Beregn verdien av starthastigheten
- For det andre må vi beregne verdien av starthastigheten.
- For å gjøre det , vil vi bruke Michaelis Mentens ligning.
- Velg Celle C5 og skriv inn formelen nedenfor:
=($F$5*B5)/(B5+$F$4)
Her inneholder Cell F5 Km , Cell F4 lagrer V-max og Celle B5 lagrer Substratkonsentrasjonen [S] .
- Deretter trykker du Enter og dra Fyllhåndtak ned.
- Som et resultat vil du se Velocity tilsvarende Konsentrasjon .
Les mer: Hvordan lage et diagram fra et utvalgt celleområde i Excel
TRINN 3: Plott Michaelis Menten-grafen med beregnet hastighet
- For å plotte grafen må du velge verdiene for Konsentrasjon og tilsvarende Velocity .
- Her har vi valgt området B4:C14 .
- Deretter går du til kategorien Sett inn og klikker på ikonet Sett inn spredning . En rullegardinmeny vises.
- Velg Scatter with Smooth Lines and Markers alternativet fra rullegardinmenyen.
- Som et resultat vil du se plottet på arket.
- Etter å ha endret akse- og diagramtitlene, grafen vil se ut som bildet nedenfor.
Les mer: Hvordan plotte graf i Excel med flere Y-akser (3 Handy Måter)
TRINN 4: Bestem starthastighet sammen med observert hastighet
- I TRINN 2 beregnet vi starthastigheten med en formel. I så fall hadde vi ikke absolutte verdier på Km og V-maks . Det var heller ingen observert hastighet.
- Hvis du har Observert hastighet som datasettet nedenfor, kan du beregne starthastigheten samt verdiene for Km og V-max .
- I dette øyeblikk velger du Celle D5 og skriv inn formelennedenfor:
=($C$17*B5)/(B5+$C$16)
- Trykk Enter og dra Fyll håndtaket ned.
TRINN 5: Finn forskjellen mellom observerte og beregnede hastigheter
- Etter å ha beregnet hastighet med Michaelis Menten-ligningen, vi må finne forskjellen mellom de observerte og beregnede hastighetene.
- For det formålet, velg Celle E5 og skriv inn formelen nedenfor:
=C5-D5
- Trykk nå Enter og dra ned Fyllhåndtaket for å se resultater.
TRINN 6: Finn summen av kvadratet av forskjeller
- For å finne de beste verdiene for Km og V-maks , må vi bestemme summen av kvadrater av forskjellene.
- For å gjøre det, velg Celle E17 og skriv inn formelen nedenfor:
=SUMSQ(E5:E14)
Her har vi brukt SUMSQ-funksjonen for å beregne summeringen av kvadrater av forskjellene.
- Trykk Enter for å se resultatet.
- For best t-verdier av Km og V-maks , må summen av kvadrater av forskjeller være minimum.
TRINN 7: Plot Michaelis Menten Graph med både observert & Beregnede hastigheter
- For å plotte grafen med både observerte og beregnede hastigheter, velg området B4:D14 .
- Deretter går du til Sett inn -fanen og klikker på Sett innScatter ikon. En rullegardinmeny vises.
- Velg Scatter with Smooth Lines and Markers alternativet fra rullegardinmenyen.
- Som et resultat vil du se grafen for både observerte og kalkulerte hastigheter.
Les mer: Hvordan plotte flere linjer i én graf i Excel
TRINN 8: Finn Michaelis Mentens konstant og V-maks
- For å finne Km og V-maks for de observerte verdiene, må vi beregne minimumsverdien av summen av kvadrater av forskjellene.
- For For dette formålet må vi ta hjelp av Solver Add-in .
- Gå til Data -fanen og klikk på Solver alternativet fra Analyse -delen.
- Hvis du ikke finner Solver-tillegget , kan du besøke denne linken .
- I boksen Solver Parameters skriver du inn cellen som inneholder verdien av Sum of Squares of Differences i feltet Sett mål . I vårt tilfelle er det Celle E17 .
- Velg deretter Min .
- Deretter skriver du inn cellene som inneholder verdiene til Km og V-maks i « By Changing Variable Cells »-feltet.
- Her har vi skrevet $C$16: $C$17 .
- Klikk Løs for å fortsette.
- I det følgende trinnet, klikk OK for å gå videre.
- Til slutt kan duvil finne de ønskede resultatene som bildet nedenfor.
TRINN 9: Sett inn halv V-maks verdi i graf
- For å sette inn Halv V-maks -verdien, må du lage et diagram som bildet nedenfor.
- Her lagrer Cell B20 0 . Også Celle B21 og Celle B22 lagrer verdien av Km .
- På den annen side, Celle C20 og Celle 21 inneholder Halv V-maks -verdien. Det betyr C17/2 . Og Cell C22 lagrer 0 .
- Etter å ha opprettet Halv V-maks tabellen, velg grafen og høyre – klikk på den. En meny vises.
- Klikk på Velg data -alternativet derfra.
- Velg deretter Legg til fra Velg datakilde -boksen.
- Velg deretter Serienavn , X-verdier og Y-verdier .
- Her er Celle 19 Serienavnet , område B20:B22 er X-verdiene , og område C20:C22 er Y – verdiene .
- Etter at du har satt inn verdiene, klikk OK .
- Igjen, klikk OK i Velg datakilde -boksen.
- Som et resultat vil du se en graf som på bildet nedenfor.
Les mer: Hvordan lage en graf fra en tabell i Excel (5 egnede måter)
TRINN 10: Endre seriediagramtype
- Til slutt, vimå endre diagramtypen for Halv V-maks verdigrafen.
- For å gjøre dette, velg Halv V-maks verdigrafen først og deretter høyre – klikk på den. En meny vises.
- Velg Endre seriediagramtype derfra.
- I Endre diagramtype -boksen, endre diagramtype for Halv V-maks verdi -grafen til spredning med rette linjer og markører .
- Deretter klikker du OK .
Sluttresultat
- Til slutt vil du få ønsket punkt der Km er 9,1 15 og V-maks er 7,328 .
Konklusjon
I denne artikkelen har vi demonstrert trinnvise prosedyrer for å plotte Michaelis Menten Graph i Excel . Jeg håper denne artikkelen vil hjelpe deg med å utføre oppgavene dine effektivt. Videre har vi også lagt til praksisboken i begynnelsen av artikkelen. For å teste ferdighetene dine kan du laste den ned for å trene. Du kan også besøke ExcelWIKI-nettstedet for flere artikler som dette. Til slutt, hvis du har noen forslag eller spørsmål, spør gjerne i kommentarfeltet nedenfor.